Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIT2O94813 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLIT2O94813 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLIT2O94813 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLIT2O94813 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLIT2O94813 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLIT2O94813 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLIT2O94813 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms