Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC9O60706 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC9O60706 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms