Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms