Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DFFAO00273 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
DFFAO00273 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DFFAO00273 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DFFAO00273 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms