Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E9PBE3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E9PBE3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E9PBE3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E9PBE3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms