Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms