Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPF2Q9HAU5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF2Q9HAU5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms