Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFDQ9GZP0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms