Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOXF2Q9BQY4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms