Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALS2CR12Q96Q35 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms