Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms