Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms