Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRIPQ8WXE1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms