Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FAT3Q8TDW7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms