Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms