Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms