Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms