Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBR1LQ6UX01 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms