Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP6Q16828 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms