Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms