Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms