Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF1AQ16665 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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