Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SYCP1Q15431 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SYCP1Q15431 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SYCP1Q15431 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SYCP1Q15431 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SYCP1Q15431 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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