Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX1-1Q15270 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX1-1Q15270 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms