Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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FOXC1Q12948 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXC1Q12948 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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