Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms