Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRJQ12913 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PTPRJQ12913 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PTPRJQ12913 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PTPRJQ12913 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PTPRJQ12913 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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