Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSM1Q08AH1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms