Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms