Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD1P98174 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD1P98174 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms