Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF1P55201 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF1P55201 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms