Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDF10P55107 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDF10P55107 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDF10P55107 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GDF10P55107 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GDF10P55107 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GDF10P55107 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms