Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PLTPP55058 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLTPP55058 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLTPP55058 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLTPP55058 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms