Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUP153P49790 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP153P49790 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP153P49790 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP153P49790 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms