Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms