Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSOP43234 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSOP43234 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSOP43234 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSOP43234 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSOP43234 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSOP43234 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms