Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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