Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD247P20963 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD247P20963 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD247P20963 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD247P20963 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms