Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms