Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP4P12644 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BMP4P12644 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms