Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms