Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms