Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms