Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms