Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms