Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms