Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRG4Q92954 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms