Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms