Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAMD12Q8N8I0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD12Q8N8I0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms