Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTF1AQ7RTS3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms